<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Dear Awasthi,<br>go through GROMACS Introductory tutorial...<br><br>trjconv -f abc.pdb -s abc.tpr -o 3frame.pdb -dump 3<br><br>You can also open the pdb file in VMD and save only the last frame<br><br>SIMPLE !<br><br>nahren<br><br>--- On <b>Mon, 2/2/09, Shirin Awasthi <i>&lt;shirin.mtechjnu@gmail.com&gt;</i></b> wrote:<br><blockquote style="border-left: 2px solid rgb(16, 16, 255); margin-left: 5px; padding-left: 5px;">From: Shirin Awasthi &lt;shirin.mtechjnu@gmail.com&gt;<br>Subject: [gmx-users] about dumping the last frame<br>To: gmx-users@gromacs.org<br>Date: Monday, February 2, 2009, 12:00 PM<br><br><div id="yiv1252206606">Hi. <br><br>I have a protein model in pdb format after trjconv command.<br>it has 3 frames, that is 3 consecutive models of the same protein.<br>how do i dump only the last frame as my final model?<br clear="all"><br>-- <br>
Shirin Awasthi<br>M.Tech (CSB)<br>Center for Computational Biology and Bioinformatics,<br>School of Information Technology,<br>Jawaharlal Nehru University,<br>New Delhi,<br>110067<br>INDIA.<br><br>
</div><pre>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list    gmx-users@gromacs.org<br>http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<br>Please search the archive at http://www.gromacs.org/search before posting!<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</pre></blockquote></td></tr></table><br>