<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Dear<span style="font-family: monospace;"> </span>Xavier Periole  <br>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
I am a GROMACS user, presently working with DM<span>PC&nbsp; b</span>ilayer.. I want to calculate the orientation of the head groups
P-N vector. From gmx-users,&nbsp; I have came to know that you have a
program that can determine the angle of the PN vector (or what ever
pair of atoms) relative to the z axis. <br>


If possible, can you please provide me that program or tell me how can i calculate that?<br>


<br>


Thanks in advance.<br>

<br>

Ms. Anindita Gaye<span>n<br>
C/</span>O Dr. Chaitali Mukhopadhyay<br>
Senior Research Fellow<br>

Department of Chemistry<br>

University of Calcutta<br>

92, A. P. C. Road<br>

Kolkata-700 009<br>

India<br><br>
</td></tr></table><br>
      <!--6--><hr size=1></hr> Add more friends to your messenger and enjoy! <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_messenger_6/*http://messenger.yahoo.com/invite/"> Invite them now.</a>