<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
<A href="mailto:gmx-users@gromacs.org"></A>&nbsp;<BR>
Hello,<BR>
I am trying to joing different .xtc fragments of a gromacs trajectory using trjcat (Gromacs 4.0.2 version). <BR>
&nbsp;<BR>
&nbsp;<BR>
trjcat_sp -f file1.xtc file2.xtc -o join1_2.xtc<BR>
&nbsp;<BR>
I get the following error:<BR>
&nbsp;<BR>
(...)<BR>
&nbsp;<BR>
Reading frame&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1 time 22202.002<BR><BR>Summary of files and start times used:<BR><BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; File&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Start time&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Time step<BR>---------------------------------------------------------<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;file1.xtc&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000 ps&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.000 ps<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; file2.xtc&nbsp;&nbsp;&nbsp; 22200.002 ps&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.000 ps<BR><BR>Reading frame&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 time&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000<BR><BR>Continue writing frames from file1.xtc t=0 ps, frame=0<BR> -&gt;&nbsp; frame&nbsp;&nbsp; 5610 time 11220.001 ps&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -&gt;&nbsp; frame&nbsp;&nbsp; 5000 time 10000.000 ps<BR>-------------------------------------------------------<BR>Program trjcat_sp, VERSION 4.0.2<BR>Source code file: xtcio.c, line: 85<BR><BR>Fatal error:<BR>Magic Number Error in XTC file (read 0, should be 1995)<BR>-------------------------------------------------------<BR><BR>
Please, could anyone help me with the origin of this error?<BR>
&nbsp;<BR>
Thank you very much for your help, in advance.<BR>
&nbsp;<BR>
Best wishes,<BR>
&nbsp;<BR>
Rebeca Garcia<BR>
Parc Cientific de Barcelona<BR>
<A href="mailto:regafan@hotmail.com">regafan@hotmail.com</A><RTE_TEXT></RTE_TEXT><BR><br /><hr />El doble de diversión: <a href='http://www.microsoft.com/windows/windowslive/products/messenger.aspx' target='_new'>Con Windows Live Messenger comparte fotos mientras hablas.</a></body>
</html>