One point here is the fact that on specfp gromacs is NOT compiled with the assembly parts. Those come from fortran. Performance hit, in different ways from different architectures and compilers due to this. ;)<br><br><div class="gmail_quote">
On Fri, Feb 13, 2009 at 10:04 AM, sobereva <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:sobjubao@yahoo.com.cn">sobjubao@yahoo.com.cn</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<br>
Hi,<br>
<br>
Gromacs is a test term of SPEC CPU2006 benchmark suite, which aims at providing a standard and comparable performance evaluation for different platform. They provided a online database <a href="http://www.spec.org/cgi-bin/osgresults?conf=cpu2006" target="_blank">http://www.spec.org/cgi-bin/osgresults?conf=cpu2006</a><br>

<br>
visit it and search the CPU name you interested, the performance on gromacs and some other scientific softwares will be listed. The performances record of the CPU based on Harpertown, Shanghai and Nehalem are now available on the database.<br>

<br>
--Lu Tian<br>
<div><div></div><div class="Wj3C7c"><br>
&gt; Dear All,<br>
&gt;<br>
&gt; could somebody already test the performance of Intel&#39;s<br>
&gt; Nehalem CPU in<br>
&gt; comparison to Harpertown or to AMD&#39;s Shanghai using<br>
&gt; Gromacs?<br>
&gt;<br>
&gt; Thanks<br>
&gt; Rainer<br>
&gt; __________________________________________________________<br>
&gt; Dr. Rainer Böckmann<br>
&gt; Theoretical &amp; Computational Membrane Biology<br>
&gt; Center for Bioinformatics Saar<br>
&gt; Universität des Saarlandes<br>
&gt; Gebäude C7.1, EG<br>
&gt; D-66041 Saarbrücken, Germany<br>
&gt; Phone: ++49 +681 302-64169 / 68627 &nbsp;FAX: ++49 +681<br>
&gt; 302-64180<br>
&gt; E-Mail: <a href="mailto:rainer@bioinformatik.uni-saarland.de">rainer@bioinformatik.uni-saarland.de</a><br>
&gt; <a href="http://www.bioinf.uni-sb.de/RB/" target="_blank">http://www.bioinf.uni-sb.de/RB/</a><br>
<br>
<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>