Hello sir,<br><br>On giving gmxdump its giving me an error saying &quot;segmentation fault.My box size  is 6x6X6.Am trying to run it it vaccum for 250 ps wit 50000 timesteps and with columb type=PME. I read from mailing list that PME calculations requires large amount of memory space.Is this an issue with dimension of box or with the system memory allocation ?Here&#39;s my log file.<br>
<br>T-Coupling&nbsp; :&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>Energy Mon. :&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>Acceleration:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>Freeze&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; :&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>User1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; :&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>
User2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; :&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>VCM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; :&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>XTC&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; :&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>Or. Res. Fit:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>QMMM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; :&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp; (total 106 atoms)<br>ben-nch0.xtc frame 0:<br>
&nbsp;&nbsp; natoms=&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp; step=&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; time=-2.9120485e-05&nbsp; prec=2.8026e-45<br>&nbsp;&nbsp; box (3x3):<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; box[&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0]={-2.89059e-05,&nbsp; 3.98821e-34, -2.39380e-05}<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; box[&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1]={ 3.98770e-34,&nbsp; 1.40130e-45, -2.91168e-05}<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; box[&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2]={-1.96789e+00, -2.91207e-05, -1.96789e+00}<br>&nbsp;&nbsp; x (1x3):<br>Segmentation fault<br>&nbsp; <br><br><br>