<span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: 16px; "><div style="margin-top: 8px; margin-right: 8px; margin-bottom: 8px; margin-left: 8px; font: normal normal normal small/normal arial; ">Hello,<div>
<br></div><div>I&#39;m interested in setting up a simulation in Gromacs based on a procedure from an interesting paper. &nbsp;The paper (available here:&nbsp;<a href="http://tinyurl.com/cp4qbu">http://tinyurl.com/cp4qbu</a>) describes simulating peptides confined to inert spherical pores.</div>
<div><br></div><div>I&#39;m not yet an advanced Gromacs user, and so I was hoping someone in the Gromacs community would be able to mention the steps necessary to build an inert spherical pore for simulation with Gromacs.</div>
<div><br></div><div>Any help is greatly appreciated!</div><div><br></div><div><br></div><div>Best regards,</div><div><br></div><div>Chester</div></div></span>