<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><DIV>Dear Gromacs Users,</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>I created a starting structure that includes 100 n-dodecane molecules ( pdb file ) using packmol. And I want to use the packmol pdb file in Gromacs 3.3 . Can I directly start generating Gromacs top and crd file with using pdb2gmx&nbsp;? For example&nbsp;to use&nbsp;a&nbsp;packmol pdb file in Amber it is necessary to add TER cards betwen each seperate molecule. Are there anything like that I must do for using packmol pdb file in Gromacs ? And units in packmol pdb file is angstrom . So Should I convert units to nm ? Finally What is the latest stable version of Gromacs ? I think Gromacs 4.0.3 is still a beta version ?</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Thanks in advance!<BR>&nbsp;<BR>Regards</DIV></td></tr></table><br>