<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Hi,<br><br>Setting<br>epsilon_r = 0<br>in your mdp file will turn off all electrostatics.<br>If you are concerned about efficiency, you should set all charges<br>in your topology to zero.<br><br>Berk<br><br><hr id="stopSpelling">Date: Tue, 24 Feb 2009 09:49:25 +0200<br>Subject: Re: [gmx-users] Turning off electrostatic or Van der Waals         interactions<br>From: omermar@gmail.com<br>To: gmx-users@gromacs.org<br><br><div dir="ltr"><div class="EC_gmail_quote"><div>Why not create "dummy" topologies, without charges/vdw ?<br>Another option, which I am not sure of its effect, is, perhaps, to take extremely small cutoffs.<br>--Omer.<br>
&nbsp;</div><blockquote class="EC_gmail_quote" style="padding-left: 1ex;"><div class="EC_Ih2E3d">Lee Soin wrote:<br>
<blockquote class="EC_gmail_quote" style="padding-left: 1ex;">
I'm trying to rule out the effect of electrostatic or Van der Waals interactions while performing a simulation. Do you mean that I should modify the code and re-compile?<br>
<br>
</blockquote>
</div></blockquote></div><br></div><br /><hr />What can you do with the new Windows Live? <a href='http://www.microsoft.com/windows/windowslive/default.aspx' target='_new'>Find out</a></body>
</html>