<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><DIV>Dear All,</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>I converted the mdcrd ( coordinates, box sizes ) and mdvel ( velocities )&nbsp; Amber trajectory files for every md record into the pdb format using ptraj in Amber. Can I use these pdb files in Gromacs for performing analysis ? Or Will I need to have some extra files to use analysis programs of Gromacs ? I will only use g_msd , g_velacc , g_energy for calculating viscosity. I'm waiting for your advices.</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Sincerely</DIV></td></tr></table><br>