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.hmmessage P
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padding:0px
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body.hmmessage
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font-size: 10pt;
font-family:Verdana
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<body class='hmmessage'>
<br>Dear all,<br><br>&nbsp;I am new about MD simulation and I have some questions about the box size.<br><br>I
had performed 1 simulation previously ( box size of 5 nm x 5 nm x 5 nm
) but now I change to a bigger molecules and increase the number of
molecules. So,the new system cannot fix into the previous box.
Therefore, I tried to Increase my box to a bigger one ( 20 nm x 20 nm x
20 nm) which can fix the system nicely. <br><br>So, is it compulsory to use certain box size in our system? or we just use<br>any box size which our molecules can fix into it, then perform MD?<br><br>Sorry for the "stupid" questions.<br><br>thanks for the comments.<br><br><br>Alvin Chan.<br /><hr />check out the rest of the Windows Live™.
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