<DIV>Dear Gromacs users</DIV>
<DIV>I'm sorry the topic is not so clear. I have run a atomic model for a few times, and the system that I want to simulate is too large to run. Now I have to build a coarse grained model of lipid bilayer. Is there anyone who has the experience?</DIV>
<DIV>I've heard that one user just success in buiding his own force field file, I think that's what I should do when I buiding the model.</DIV>
<DIV>Here is my plan:</DIV>
<DIV>1. write a gro/pdb file of the model (can VMD do this?)</DIV>
<DIV>2. write force field file and .itp/.rtp file</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>What should I do next? So confused.</DIV>
<DIV>Is there any software could help me to do this more convenient? I've just learned Vi.</DIV>
<DIV>Any suggestion is welcome.</DIV>
<DIV>Thank you for your help!</DIV><br><!-- footer --><br><span title="neteasefooter"/><hr/>
<a href="http://www.yeah.net">网易邮箱，中国第一大电子邮件服务商</a>
</span>