Hai !<br> <br>with &quot;pdb2gmx -ss&quot;, i can select the ss bonds. But after that, how to break a particular ss bond (not all).<br>     Thank you<br> <br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Mar 6, 2009 at 11:01 AM, sharada <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:sharada@ccmb.res.in">sharada@ccmb.res.in</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><div><br>pdb2gmx -h <br><br>sharada<br><br><font face="Arial" size="2"><table style="border-color: blue; border-left: 1px solid blue; padding-left: 5px;">
<tbody><tr><td><div><div></div><div class="h5"><br><b><i>-- Original Message --</i></b><br>From: Venkat Reddy &lt;<a href="mailto:venkat4bt@gmail.com" target="_blank">venkat4bt@gmail.com</a>&gt;<br>To: Discussion list for GROMACS users &lt;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a>&gt;<br>
Date: Fri, 6 Mar 2009 10:50:24 +0530<br>Subject: [gmx-users] How to break a disulfide bond ???<br><br>Hai Every one ! Is it possible to break a disulfide bridge using gromacs ?????If so,Can anybody suggest me, how to do it???<br clear="all">
<br>Thanks for ur valuable time<br><br>With best wishes<br>Venkat Reddy Chirasani<br>M.Tech Bioinformatics<br>UNIVERSITY OF HYDERABAD<br></div></div>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a></td>
</tr></tbody></table></font></div><br>_______________________________________________<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Venkat Reddy Chirasani<br>
M.Tech Bioinformatics<br>UNIVERSITY OF HYDERABAD<br>