<P>
Dear GROMACS users,<BR>
<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  As explained in the manual ( page 139, section 6.5/3.3.3) I would like to calculate viscosity of my system ( water) using g_energy. I opted&nbsp; &nbsp; (40&nbsp; Mu-X ) from the g-energy selection. But the unit written on the Y axis of the corresponding xvg file is&nbsp; (kJ mol\S-1\N). I think GROMACS uses SI unit , which is Pa-Second in the case of viscosity. Then why is this discrepancy.? Or did I make any mistake?<BR>
<BR>
<BR>
------I give the command on the prompt:<BR>
<BR>
g-energy -f ener.edr - o viscosity.xvg ; <BR>
then chose option 40 ( Mu-X).<BR>
<BR>
system details:<BR>
******************<BR>
My system consists of 500 TIP4P water molecules, ran for 3.5 nanoseconds at 150K, the ensemble is NPT. The version I am using is 3.3.3<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
regards,<BR>
Jes
</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1050715198@Middle5/2705639_2677138/2680796/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null' target=new ><img src ='http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/2705639_2677138/creative_2680796.gif'  alt='Shopping'  border=0></a></td></TR></Table>