<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><span><font size="3"><font face="Calibri">Dear Users,<br><br>I'm trying
to obtain .gro and top files successfuly for my n-alkanes molecules and
want to run md simulations both using oplsaa and </font></font></span>Gromos96 <span class="yshortcuts" id="lw_1236953427_0">force fields</span>
seperately. Then I will compare the results of two md runs. I think
that I can generate itp files for Gromos96 force fields&nbsp; using prodgr
server and use them for md. But I sholud&nbsp; write itp files for each
molecules I want to use for oplsaa . Lets say that I produced itp
files, How can I use for example two different itp files and generate a
top file like in below. I'm confused about this. Could you give me the information about this
procedure ?<br><br>Sincerely<br><br>#include "ffoplsaa.itp"<br><br>#include "molecule_A.itp"<br>#include "molecule_B.itp"<br><br><br><br>[ system ]<br>packmol system<br><br>[ molecules ]<br>Molecule_A&nbsp; &nbsp;
 N<br>Molecule_B&nbsp; &nbsp; N</td></tr></table><br>