<P>
&nbsp; <BR>
Hi everyone,<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  I want to know whether anyone has done k-means clustering using gromacs <BR>
3.3.1.<BR>
&nbsp; I saw that one program has been contributed to do k-means clustering using &quot;g_cluster&quot;. <BR>
Has anyone tried to use this program to do such clustering.<BR>
<BR>
I would also like to know the correct command option to cluster conformations based on <BR>
&quot;pairwise rmsd&quot; using &quot;g_cluster&quot;.<BR>
<BR>
Any suggestion will be extermely helpful.<BR>
<BR>
Thanks in advance<BR>
Sarbani
</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style="font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;"><TR><td><A HREF="http://sigads.rediff.com/RealMedia/ads/click_nx.ads/www.rediffmail.com/signatureline.htm@Middle?" target="_blank"><IMG SRC="http://sigads.rediff.com/RealMedia/ads/adstream_nx.ads/www.rediffmail.com/signatureline.htm@Middle"></A></td></TR></Table>