<div>Respected Sir,</div>
<div> </div>
<div>Thanks for your mail.</div>
<div>I will work on this.</div>
<div> </div>
<div>Thanking you,</div>
<div>Pawan<br><br> </div>
<div><span class="gmail_quote">On 4/7/09, <b class="gmail_sendername">Mark Abraham</b> &lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt; wrote:</span>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid"><span class="q">Pawan Kumar wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Hello Sir,<br><br>Can you please tell me how to couple ions with SOL ?<br>Is there any command in gromacs to do that ?<br>
</blockquote><br></span>You need to define a group with SOL and the ions in an index file. This is uses as input to grompp so that it can make sense of the same group name when used in the .mdp file. See <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="http://wiki.gromacs.org/index.php/Index_File" target="_blank">http://wiki.gromacs.org/index.php/Index_File</a><br>
<span class="sg"><br>Mark</span> 
<div><span class="e" id="q_1207f76ae2933f99_3"><br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list    <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a onclick="return top.js.OpenExtLink(window,event,this)" href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></span></div></blockquote>
</div><br>