<div>Hello sir,</div>
<div> </div>
<div>From last few days , i was using TINKER for implicit simulations using force field oplsaa</div>
<div>Now for explicit one, i switched to gromacs version 4.0.But if i take pdb file from tinker (molecular modelling software) and paste it in The Dundee Prodrg server. i got my *.itp file, *.gro file.</div>
<div> </div>
<div>But if i use force field as ffoplsaa or ffG43a1 or any other force field except ffgmx. I always got error in atom type not found.</div>
<div> </div>
<div>Tell me what to do.</div>
<div> </div>
<div>Can i switch to gromacs older version i.e.3.3.1???</div>
<div> </div>
<div>Whether i can use The Dundee Prodrg server for peptides having usual amino acid???</div>
<div> </div>
<div>With regards,</div>
<div>Bhawana</div>