Hi list!<br><br>Is there the possibility of the g_dist program don&#39;t provide the correct com-com distances for molecules simulated in triclinic cells <br>under anisotropic pressure?<br><br>(I&#39;ve been calculating com-com distances in order to study the clustering of lipids self-assembled. For it, I&#39;ve written a simple <br>
code reads coordinates, calculate com positions, make the 26 images for each one and verify the smallest distance between com(lipid A) <br>and com(lipid B) among all the 27 combinations. In 63% of all lipid-lipid combinations, the distances obtained for both programs are <br>
equal and others 20% my code obtains smaller values. For the calculations I&#39;ve obtained the vectors for the rectangular box in g_energy, <br>using Box_XX, Box_YY and Box_ZZ options; I didn&#39;t use the vectors of the skewed box.)<br>
<br>Thanks.....<br><br>Fernando C. Lopes F., PhD student<br>Department of Physics<br>UNESP - São Paulo State University<br>15054-000 São José do Rio Preto, São Paulo, Brazil<br>e-mail: <a href="mailto:ffilho@ibilce.unesp.br">ffilho@ibilce.unesp.br</a><br>