"hello gromacs,
<div>i am trying to simulate my protein ligand complex but my protein
contains Mg ion and while running Gromacs error is coming in command
pdb2gmx.It is not able to recognize Mg ion.<br>I included the coordinates
for Mg ion in protein pdb file.And when i included coordinates for Mg
ion in ligand file , Prodrg server was showing error during generation
of ligand toplogy file as it doesnt include Mg ion.</div>
So pls suggest me how can i do this job..&quot;<br clear="all"><br><br>AKALABYA BISSOYI.<br>N.I.T.Rourkela<br>