Dear all,<br><br>I have generated .itp file for ligand using PRODRG server which i included in topology file. Now for position restrained dynamics, i wanted to restrain atom positions for ligand and protein . But porse.itp which generated using pdb2gmx contain restraints for protein only. Kindly provide me the solution to restrain ligand atoms.<br>
<br>Thanks,<br>Hitesh Singla<br>