<HTML><HEAD>
<META content="KsDHTMLEDLib.ocx, FreeWare HTML Editor 1.164.2, ?Kurt Senfer" 
name=GENERATOR>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=GB2312"></HEAD>
<BODY 
style="BACKGROUND-POSITION: left 0px; SCROLLBAR-FACE-COLOR: #c3d3fd; FONT-SIZE: 9pt; MARGIN: 10px; SCROLLBAR-HIGHLIGHT-COLOR: #ffffff; SCROLLBAR-SHADOW-COLOR: #261fba; COLOR: #400080; SCROLLBAR-3DLIGHT-COLOR: #7b9ed6; SCROLLBAR-ARROW-COLOR: #4a6184; BACKGROUND-REPEAT: repeat; FONT-FAMILY: Verdana; SCROLLBAR-DARKSHADOW-COLOR: #bebebe" 
text=#400080 vLink=#0000ff aLink=#0000ff link=#0000ff bgColor=#ffffff 
background=cid:Attr_42235933366 scroll=yes ORGYPOS="0" 
SIGCOLOR="255">
<TABLE cellSpacing=0 cellPadding=2 width="100%" border=0>
  <TBODY>
  <TR>
    <TD width="100%">
      <TABLE style="MARGIN: 3px; WIDTH: 100%" width="100%">
        <TBODY>
        <TR>
          <TD>
            <DIV><IMG alt="" hspace=0 
            src="cid:Attr_42236094570" align=baseline 
            border=0></DIV></TD></TR></TBODY></TABLE></TD></TR>
  <TR>
    <TD 
    style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 0px; FONT-SIZE: 9pt; PADDING-BOTTOM: 0px; CURSOR: text; PADDING-TOP: 0px" 
    vAlign=top width="100%">
      <DIV>To whom it may concern£¬</DIV>
      <DIV>&nbsp;</DIV>
      <DIV>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; when I used g_saltbr to 
      compute&nbsp;some salt bridges in my system, I couldn't&nbsp;understand 
      the&nbsp;option "-t".&nbsp; The tutorial tell me that it's trunc distance 
      and the default is 1000. Then I want to find the definition of the salt 
      bridge in Gromacs. However, I couldn't find it.&nbsp; Could you like to 
      tell me the relative definition in Gromacs? And what is a proper value for 
      the option t?</DIV>
      <DIV>&nbsp;</DIV>
      <DIV>&nbsp;</DIV>
      <DIV>Look forward to your early reply, </DIV>
      <DIV>&nbsp;</DIV>
      <DIV>Regards,</DIV>
      <DIV><!--AID_EDIT_ATTACHMENT_BEGIN--><!--AID_EDIT_ATTACHMENT_END--></DIV>
      <DIV><!--AID_FROMNAME_BEGIN-->mary</DIV>
      <DIV><!--AID_FROMNAME_END-->2009-04-23 </DIV></TD></TR>
  <TR>
    <TD width="100%">
      <TABLE cellSpacing=0 cellPadding=0 width="100%">
        <TBODY>
        <TR>
          <TD>
            <DIV align=right><IMG id=INCREDISETASATTACH alt="" hspace=0 
            src="cid:Attr_42236254553" align=baseline 
            border=0></DIV></TD></TR></TBODY></TABLE></TD></TR></TBODY></TABLE></TD></TR></TBODY></TABLE></BODY></HTML>