<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Dear gmx users,<BR>
&nbsp; Usually, we perform NPT MD to achieve optimized density of system and start another NVT MD to calculate other properties of interest.&nbsp; I think there are&nbsp;three possible ways to choose the structure to start another NVT MD:(1) the structure of last step in NPT MD trjectory;(2)the structure in NPT MD trjectory with the density closest to the averaging density;(3)the structure of last step in NPT MD trjectory but the box size needs to be rescaled so that it is the averaging size. My question is: which&nbsp;way should be chosen to start another NVT MD? I do not know whether this question is suitable here. Any hints would be thanked very much.<BR>
Best wishes,<BR>
xiaowu<BR>
&nbsp;<BR><br /><hr />更多热辣资讯尽在新版MSN首页! <a href='http://cn.msn.com/' target='_new'>立刻访问!</a></body>
</html>