Also I have checked that it works well in gmx_3.3.3. Anyone can tell me what is the problem ?  Thanks!<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 6, 2009 at 1:47 PM, Yanmei Song <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ysong30@asu.edu">ysong30@asu.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><span></span> Dear All:<br><br>I just installed the gmx_4.0.4 double precision.<br><br>When I do EM, the grompp_d command has no problem. However after I submit the job, it gives me the following error. Anyone can tell me what is the problem which may cause that? By the way, in 4.0.4, it can only use 4 CPU, right? Can we still specify how much CPU we want to use by -np?<br>

<br>Reading file /home/ysong30/pdm80/em.tpr, VERSION 4.0.4 (double precision)<br><br>-------------------------------------------------------<br>Program mdrun, VERSION 3.3.3<br>Source code file: tpxio.c, line: 1192<br><br>

Fatal error:<br>reading tpx file (/home/ysong30/pdm80/em.tpr) version 58 with version 40 program<br><font color="#888888"><br clear="all"><br>-- <br>Yanmei Song<br>Department of Chemical Engineering<br>ASU<br>
</font></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Yanmei Song<br>Department of Chemical Engineering<br>ASU<br>