Dear Mark<br><br>              Thanks for your kind reply . Actually I am just starting the simulation of DnA-protein complex using gromacs. I got the  amber charged  force field ( to find DNA residues) from <a href="http://golovin_at_genebee.msu.su">golovin_at_genebee.msu.su</a>&quot; and &quot;<a href="http://burnnick_u_at_rambler.ru">burnnick_u_at_rambler.ru</a>&quot; this site . The name of force field is ffoplsaano .<br>
<br>BY using this I given the command like this-<br> pdb2gmx -f dbd.pdb -o dbd.gro -p dbd.top -i dbd.itp -ff oplsaano<br><br>Then I am getting error like this-<br><br>Program pdb2gmx, VERSION 4.0.3<br>Source code file: h_db.c, line: 96<br>
<br>Fatal error:<br>Error in hdb file ffoplsaano.hdb:<br>Wrong number of control atoms (2 iso 3) on line:<br>1       1       N       -C      CA<br><br>Can u please help me in solving this problem.?<br>What does mean 2 iso 3?<br>
<br>Nitu Sharma<br><br><br>