Dear all <br><br>                 I want remove water molecules from hydrophobic core of lipid by using  script Keepbyz.pl by (chris neale) . I want to know  basis of deciding uprez and lowrez variables . I mean to say how can I decide which value of uprez and lowrez is suitable for my system protein embedded in lipid bilayer.<br>
<br>If anyone did these things please help me in solving this problem.<br><br>I will be really thankful for that.<br><br>Nitu Sharma<br>School of Life Sciences<br>Jawaherlal Nehru University<br>New delhi , India<br>