<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><br>Hi Dallas, Mark &amp; Chris,<br><br>Thanks a lot for your replies.<br>Yes, the problem was due to visualization artifacts and was solved by using the "dynamic bonds" representation of VMD. Thanks a lot.<br><br>Regards,<br><br><div><font color="#0000bf" size="4"></font>&nbsp;</div><div style="color: rgb(0, 0, 191);"><strong>Anirban Ghosh</strong></div><div style="color: rgb(0, 0, 191);"><strong>Grade Based Engineer<br>Bioinformatics Team<br>Centre for Development of Advanced Computing (C-DAC)<br>Pune, India<br></strong></div></td></tr></table><br>
      <!--10--><hr size=1></hr> From Chandigarh to Chennai - find friends all over India. <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_groups_10/*http://in.promos.yahoo.com/groups/citygroups/"> Click here.</a>