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.hmmessage P
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padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
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<body class='hmmessage'>
Hi,<br><br>Yes, you can use NPT, the code takes care of this properly.<br>Strictly speaking it might be incorrect, but since pressure scaling is usually less than 1%<br>it will not affect your results significantly.<br><br>Berk.<br><br><hr id="stopSpelling">Date: Mon, 25 May 2009 15:19:10 -0700<br>From: ysong30@asu.edu<br>To: gmx-users@gromacs.org<br>Subject: [gmx-users] Viscosity using periodic perturbation method<br><br>Dear users:<br><br>I was trying to calculate the viscosity of liquid system using periodic perturbation method. Does this method require NVT ensemble simulation in stead of NPT ? Because I read some literature on periodic perturbation method. they all used NVT.&nbsp; I did not found any information about this on the manual. Can I use NPT Non-equilibrium MD in order to use periodic perturbation method? Thanks in advance!<br>
-- <br>Yanmei Song<br>Ph.D. Candidate<br>Department of Chemical Engineering<br>Arizona State University<br><br /><hr />Express yourself instantly with MSN Messenger! <a href='http://clk.atdmt.com/AVE/go/onm00200471ave/direct/01/' target='_new'>MSN Messenger</a></body>
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