Hi All,<br> <br>I was doing some MD simulation over the docked complex and following the drug-enzyme tutorial for the same. The tutorial provided by Kerrigan&#39;s is really helpful. Only problem with the tutorial is generating topologies, for which PRODRG server is suggested. I want to use some stand alone package for generating the topologies which can run on local machine. <br>
Does anybody have idea of such packages ?<br><br>Suggest me any other alternate of generating topologies.<br><br>With thanks in advance..<br>~Vivek<br><br>