<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Hi ALL,<br><br>I have a system of a GPCR protein in a lipid bilayer. I want to extend<br>the water layer along the negative Z-direction. I found a script by Chris<br>at the GROMACS mail list. But I am unable to use it properly. Can anyone<br>please explain how to use it to extend the water layer only in the<br>negative Z-direction. And also what does "upeerz and lowerz" signify? Is it for the protein or the water layers? Thanks a lot in advance.<br><br>Regards,<br><br><div><font color="#0000bf" size="4"></font>&nbsp;</div><div style="color: rgb(0, 0, 191);"><strong>Anirban Ghosh</strong></div><div style="color: rgb(0, 0, 191);"><strong>Grade Based Engineer<br>Bioinformatics Team<br>Centre for Development of Advanced Computing (C-DAC)<br>Pune, India<br></strong></div></td></tr></table><br>


      <!--3--><hr size=1></hr> Explore and discover exciting holidays and getaways with Yahoo! India Travel <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_Travel_1/*http://in.travel.yahoo.com/"> Click here!</a>