<span style="color: rgb(255, 0, 0);"><span style="color: rgb(0, 0, 0);">Hi ..<br>
I am using gromacs 4.0 for simulating a protein molecule. i am getting
following problem during md run    [md.mdp  </span></span>dt =0.002 ; ps ! nsteps = 100000 ; total 200.0 ps ]<br>

<span style="color: rgb(255, 0, 0);"><span style="color: rgb(0, 0, 0);"></span><br>
<span style="font-style: italic; color: rgb(0, 0, 0);">t = 47.530 ps: Water molecule starting at atom 46763 can not be settled.</span></span><span><br style="font-style: italic; color: rgb(0, 0, 0);">
<span style="font-style: italic; color: rgb(0, 0, 0);">Check for bad contacts and/or reduce the timestep.<br>
<br>
</span>What should i have to do ? please help me..<br>
<br>
Rituraj</span><br><br><br>