<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Hi ALL,<br><br>In previous posts I mentioned the problem I am facing: a portion of my protein (GPCR in a POPC bilayer) in extending out of the water box in negative Z-direction, how to extend the water in that direction. I have gone through the PBC section of the manual. While changing the Z coordinate value of the last line of the .gro file I am able to extend the water layer in the positive Z direction. But I am not able to extend it in the opposite direction. Decreasing the Z coordinate value is not helping that. How to do this? Any suggestion is welcome.<br><br>Regards,<br><br><br><br><div><font color="#0000bf" size="4"></font>&nbsp;</div><div style="color: rgb(0, 0, 191);"><strong>Anirban Ghosh</strong></div></td></tr></table><br>


      <!--3--><hr size=1></hr> Explore and discover exciting holidays and getaways with Yahoo! India Travel <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_Travel_1/*http://in.travel.yahoo.com/"> Click here!</a>