<div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi<br><br>Recently I successfully installed the gromacs-4.0.5 mpi version.<br>
I could run in 8 cpu. but the speed is very slow. <br>Total number of atoms in the system is 78424.<br>while running all 8 cpu showing 95-100% CPU.<br>
<br>How to speed up the calculation.<br><br>Thanks<br><br>
</blockquote></div><br>