<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html><head><title>MPI gromacs under cygwin</title>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=windows-1251">
<meta http-equiv="Content-Style-Type" content="text/css">
<style type="text/css"><!--
body {
  margin: 5px 5px 5px 5px;
  background-color: #ffffff;
}
/* ========== Text Styles ========== */
hr { color: #000000}
body, table /* Normal text */
{
 font-size: 9pt;
 font-family: 'Courier New';
 font-style: normal;
 font-weight: normal;
 color: #000000;
 text-decoration: none;
}
span.rvts1 /* Heading */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-weight: bold;
 color: #0000ff;
}
span.rvts2 /* Subheading */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-weight: bold;
 color: #000080;
}
span.rvts3 /* Keywords */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-style: italic;
 color: #800000;
}
a.rvts4, span.rvts4 /* Jump 1 */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 color: #008000;
 text-decoration: underline;
}
a.rvts5, span.rvts5 /* Jump 2 */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 color: #008000;
 text-decoration: underline;
}
span.rvts6
{
 font-size: 8pt;
 font-family: 'arial';
 font-style: italic;
 color: #c0c0c0;
}
a.rvts7, span.rvts7
{
 font-size: 8pt;
 font-family: 'arial';
 color: #0000ff;
 text-decoration: underline;
}
/* ========== Para Styles ========== */
p,ul,ol /* Paragraph Style */
{
 text-align: left;
 text-indent: 0px;
 padding: 0px 0px 0px 0px;
 margin: 0px 0px 0px 0px;
}
.rvps1 /* Centered */
{
 text-align: center;
}
--></style>
</head>
<body>

<p>Hi, all!</p>
<p><br></p>
<p>Is are any who uses GMX in MPI mode under cygwin?</p>
<p><br></p>
<p>I'm trying to install it. Based on oldgromacs site and wiki I installed cygwin, FFTW and LAM/MPI. Unfortunately I failed to install libaio and leaved it out. But when configuring gromacs with</p>
<p><br></p>
<p>./configure --enable-mpi --disable-float --enable-sse2 --enable-shared LDFLAGS='-L/usr/local/lib'</p>
<p><br></p>
<p>it returns&nbsp;</p>
<p><br></p>
<p>checking for mpicc... mpicc</p>
<p>checking whether the MPI cc command works... configure: error: Cannot compile and link MPI code with mpicc</p>
<p><br></p>
<p>Alternatively I try "Quick and Dirty Installation" from wiki with openmpi, where all is OK until Gromacs configuring with</p>
<p><br></p>
<p>./configure --prefix=$SOFT --enable-mpi --with-gsl</p>
<p><br></p>
<p>The end of return is</p>
<p><br></p>
<p>checking for mpxlc... no</p>
<p>checking for mpicc... no</p>
<p>checking for mpcc... no</p>
<p>checking for hcc... no</p>
<p>checking whether the MPI cc command works... configure: error: Cannot compile and link MPI code with cc</p>
<p><br></p>
<p>Thanks in advance!</p>
<p><span class=rvts6><br></span></p>
<p><span class=rvts6>--&nbsp;</span></p>
<p>Regards<span class=rvts6>,</span></p>
<p><span class=rvts6>&nbsp;Dmitri &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;</span><a class=rvts7 href="mailto:ddubov@ngs.ru">mailto:ddubov@ngs.ru</a></p>

</body></html>