<div class="gmail_quote">On Mon, Jun 29, 2009 at 12:54 PM, Manik Mayur <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:manik.mayur@gmail.com">manik.mayur@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">

Hi,<br>I am trying to install GROMACS-4.0.5, but while making mpirun with the option --enable-mpi it gives the following sets of errors:<br></blockquote><br>read &quot;making mdrun&quot;<br><br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">

../gromacs-4.0.5/src/gmxlib/.libs/libgmx_mpi.so: undefined reference to `ah_find&#39;<br>
../gromacs-4.0.5/src/gmxlib/.libs/libgmx_mpi.so: undefined reference to `lam_ksignal&#39;<br>../gromacs-4.0.5/src/gmxlib/.libs/libgmx_mpi.so: undefined reference to `lam_arr_append&#39;<br>../gromacs-4.0.5/src/gmxlib/.libs/libgmx_mpi.so: undefined reference to `ah_delete&#39;<br>


../gromacs-4.0.5/src/gmxlib/.libs/libgmx_mpi.so: undefined reference to `lam_errorstr&#39;<br>../gromacs-4.0.5/src/gmxlib/.libs/libgmx_mpi.so: undefined reference to `lam_ssi_cr_did&#39;<br>../gromacs-4.0.5/src/gmxlib/.libs/libgmx_mpi.so: undefined reference to `lam_rtrnameget&#39;<br>


../gromacs-4.0.5/src/gmxlib/.libs/libgmx_mpi.so: undefined reference to `lam_mutex_trylock&#39;<br>...................<br>...................<br><br>The important thing to note is that I have successfully compiled and installed mpi version of mdrun on the same machine, for GROMACS-4.0.4.<br>


What am I missing here?<br>Thanks,<br><font color="#888888"><br clear="all">Manik Mayur<br>Graduate student<br>Microfluidics Lab<br>Dept. of Mechanical Engg.<br>IIT Kharagpur<br>INDIA<br>
</font></blockquote></div><br>