<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Hi Dmitri,<br>
It's the last frame - the file is written after all frames are read and
dealt with.<br>
Best regards,<br>
Ran<br>
<br>
Dmitri Dubov wrote:
<blockquote cite="mid962906161.20090716141908@ngs.ru" type="cite">
  <title>indexing largest cluster with g_clustsize</title>
  <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; ">
  <meta http-equiv="Content-Style-Type" content="text/css">
  <style type="text/css"><!--
body {
  margin: 5px 5px 5px 5px;
  background-color: #ffffff;
}
/* ========== Text Styles ========== */
hr { color: #000000}
body, table /* Normal text */
{
 font-size: 9pt;
 font-family: 'Courier New';
 font-style: normal;
 font-weight: normal;
 color: #000000;
 text-decoration: none;
}
span.rvts1 /* Heading */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-weight: bold;
 color: #0000ff;
}
span.rvts2 /* Subheading */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-weight: bold;
 color: #000080;
}
span.rvts3 /* Keywords */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-style: italic;
 color: #800000;
}
a.rvts4, span.rvts4 /* Jump 1 */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 color: #008000;
 text-decoration: underline;
}
a.rvts5, span.rvts5 /* Jump 2 */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 color: #008000;
 text-decoration: underline;
}
span.rvts6
{
 font-weight: bold;
 color: #800000;
}
span.rvts7
{
 font-weight: bold;
 color: #800080;
}
a.rvts8, span.rvts8
{
 color: #0000ff;
 text-decoration: underline;
}
span.rvts9
{
 font-weight: bold;
 color: #800000;
}
span.rvts10
{
 font-size: 8pt;
 font-family: 'arial';
 font-style: italic;
 color: #c0c0c0;
}
a.rvts11, span.rvts11
{
 font-size: 8pt;
 font-family: 'arial';
 color: #0000ff;
 text-decoration: underline;
}
/* ========== Para Styles ========== */
p,ul,ol /* Paragraph Style */
{
 text-align: left;
 text-indent: 0px;
 padding: 0px 0px 0px 0px;
 margin: 0px 0px 0px 0px;
}
.rvps1 /* Centered */
{
 text-align: center;
}
--></style>
  <p>Dear gmx'ers!</p>
  <p><br>
  </p>
  <p>One more question on g_clustsize routine:</p>
  <p>It produces an index file with the atom numbers of largest
cluster. But how it works in an evaporating system where the number of
clustered molecules reduces greatly through the trajectory? What frame
the maxclust.ndx file concerns to?</p>
  <p><span class="rvts10">--&nbsp;</span></p>
  <p><span class="rvts10">Regards</span></p>
  <p><span class="rvts10">&nbsp;Dmitri &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;</span><a
 class="rvts11" href="mailto:ddubov@ngs.ru">mailto:ddubov@ngs.ru</a></p>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
_______________________________________________
gmx-users mailing list    <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
Please search the archive at <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 
www interface or send it to <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.
Can't post? Read <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a></pre>
</blockquote>
<br>
<br>
<pre class="moz-signature" cols="72">-- 
------------------------------------------------------
Ran Friedman
Postdoctoral Fellow
Computational Structural Biology Group (A. Caflisch)
Department of Biochemistry
University of Zurich
Winterthurerstrasse 190
CH-8057 Zurich, Switzerland
Tel. +41-44-6355559
Email: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:r.friedman@bioc.unizh.ch">r.friedman@bioc.unizh.ch</a>
Skype: ran.friedman
------------------------------------------------------
</pre>
</body>
</html>