Hi,<br>
<br>
i am trying to run md for protein-peptide complex. the peptide has<br>
phosphorylated tyrosine.<br>
<br>
i got the following error when i run pdb2gmx<br>
<br>
Fatal error:<br>
Error in hdb file ffG43a1p.hdb:<br>
Wrong number of control atoms (2 iso 3) on line:<br>
    1    1    N    -C    CA<br><br>I also tried with phosphoserine, i got the same error as for phosphotyrosine.<br>I am using gromacs-4.0.2.<br>
<br>
<br>
I would greatly appreciate if some one help me to solve this error.<br>
<br>
Thanking you,<br>
<br>
Yours sincerely,<br>
Thamu