Hello,<br><br>I&#39;m using ffoplsaa with a new atom type (Ag) that I&#39;ve included in the .atp file, LJ parameters I&#39;ve specified in the nb file.  My system topology I&#39;ve written by hand in an itp file.  The problem is that after any kind of run the molecule penetrates the metal surface!  This shouldn&#39;t be happening.  I had been using g45a3 quite successfully for the same system and everything was working fine.  Do I need to do something different/special with oplsaa?  What am I missing?<br>
<br>Advice appreciated,<br>Chris Rowan   <br><br>