<div>Hello users,<br></div><div></div><div>I have a question about the Gromacs parameterization. </div><div></div><div>By using which water model (SPC / SPC/E / TIP3P etc) and their variants, the protein force field parameters in GROMACS were optimized ? </div>
<div>Since a few of the properties of proteins depends upon the water models we employ (for instance, SPC water model over estimates the </div><div>diffusion properties of the proteins by a factor of approx. 2). it is necessary to know which water model needs to be used in the simulation.</div>
<div></div><div>Thanks in advance.</div><div>Ram. <br><br></div>