<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:arial, helvetica, sans-serif;font-size:10pt"><DIV>Hello</DIV>
<DIV>In the file ffG43a1bon.itp, the bond parameters are given like this-</DIV>
<DIV>------------------------------</DIV>
<DIV><FONT size=2>
<P>ICB(H)[N] CB[N] B0[N]</P>
<P>;</P>
<P>#define gb_1 0.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1000 1.5700e+07</P>
<P>; H - OA&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;750 </P>
<P>;</P>
<P>#define gb_2 0.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1000 1.8700e+07</P>
<P>; H - N (all)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 895 </P>
<P>;</P>
<P>#define gb_3 0.&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1090&nbsp;&nbsp;1.2300e+07</P>
<P>; HC - C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 700 </P>
<P>------------------------------------</P>
<P>Can anybody please tell me, which one is is the force constant and which one is ideal bond length. For describing a new bond parameters , what the values <BR>I have to provide in the file ffG43a1bon.itp.</P>
<P>The ffG43a1bon.itp is not clearly described in the chapter5 of the manual of gromacs version4.</P>
<P>&nbsp;</P>
<P>Subarna</P></FONT></DIV></div><br>
      <!--3--><hr size=1></hr> See the Web&#39;s breaking stories, chosen by people like you. Check out <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_buzz_1/*http://in.buzz.yahoo.com/" target="_blank"> Yahoo! Buzz</a>.</body></html>