<div style="font-family: 'times new roman'; font-size: 16px"><div><br /></div><div>On 08/07/09, <b class="name">Morteza Khabiri </b>&lt;khabiri@greentech.cz&gt; wrote:</div><blockquote cite="mid:9084.160.217.215.124.1249627839.squirrel@www.greentech.cz" class="iwcQuote" style="border-left: #00f 1px solid; padding-left: 13px; margin-left: 0px" type="cite"><div class="mimepart text plain">Dear users<br /><br />I have a dimer protein which I want to minimized it..unfortunately the<br />protein is in high energy level and before starting to minimize it<br />explode.<br />I already went through users email and also wiki gromacs and also I tried<br />all the way like changing time step, change coulomb type ,... but they did<br />not work and still the protein at the first step of minimization<br />exploding......<br />is there any suggestion to get ride of from this problem???</div></blockquote><div><br/></div><div>I answered this question less than 12 hours ago. Please don't re-post.</div><div><br/></div><div>Mark</div></div>