<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Dear users, <BR>
&nbsp; Recently, I encounter a very&nbsp;strange thing while perfoming MD using GROMACS.&nbsp;With the same minimization&nbsp;parameters, mdrun can generate different configuration in parallel way or not. It seems that the former one&nbsp;leads to obvious exploding of the configuration into parts&nbsp;whereas the latter one can obtain a reasonable configuration. Noted that the system is a polymer (dendrimer) without pbc. I wonder if this is a bug for MPI of GROMACS. Could you give me some hints? Thanks a lot for your attention!<BR>
&nbsp;<BR>
Best regards,<BR>
Chaofu Wu, Dr.<BR>
&nbsp;<BR><br /><hr />与任何您希望的人分享您的回忆。 <a href='http://www.microsoft.com/china/windows/windowslive/products/photos-share.aspx?tab=1' target='_new'>任何您希望的人。</a></body>
</html>