I am trying to solvate a peptide which has an acetylated N-terminus in the opls-aa force field. Running pdb2gmx (v. 4.0.2) gives me the following error:<br><br>Error 1<br>No default Ryckaert-Bell types. <br><br>The guilty atoms in the topology are 4 atoms at the N-terminus. This issue has been raised before as well in the mailing lists. <br>
<br>Is there a way to fix this?<br><br>thank you<br><br>-Maria.<br><br><br clear="all"><br>-- <br>Maria G.<br>Technical University of Denmark<br>Copenhagen<br>