<br><br>Hi<br><br>After the two commands, <br>grompp_mpi -v -f minim.mdp -c 6LYZ.gro -p 6LYZ.top -o 6LYZ-EM-vacuum.tpr<br><br>mpiexec -np 16 mdrun_mpi -v -deffnm 6LYZ-EM-vacuum<br><br><br><br>Fatal error:<br>pbc type no is not supported with domain decomposition,<br>
use particle decomposition: mdrun -pd<br><br><br><br>What does it mean?<br><br>Thank you<br>Lin<br><br>