<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">hi all,<br>i have simulated a membrane protein system in DPPC and DMPC bilayer. i have got the trajectories and analysed them with the gromacs tools. now i want to get the bonding connectivity of the protein with that of the lipid layer. can i get that graphically (i.e. in xvg format) ? is there any option to visualize the protein - lipid connections other than ngmx? as the system is big enough i cant get a clear idea about the bonding patterns of the protein with the lipid bilayer....waiting for suggestions....<br>Thank You all<br>Shamik<br></td></tr></table><br>
      <!--1--><hr size=1></hr> Love Cricket? Check out live scores, photos, video highlights and more. <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_cricket_2/*http://cricket.yahoo.com" target="_blank"> Click here</a>.