<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=koi8-r">
<META content="MSHTML 6.00.2900.2180" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV>Dear GMX'ers,</DIV>
<DIV>&nbsp;&nbsp; Is there any reliable way of making an itp file for an 
arbitrary structure? AFAIK there are two ways:</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; 1) The Dundee 
PRODRG server. This is really a nice tool, but it always gives the same 
protonation states. COOH always becomes COO- and NH2 becomes NH3+. </FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; 2) x2top. 
This utility hangs with my rather simple structure. The structure 
is&nbsp;attached below. This is a file created by SwissPDB. It contains 
hydrogens and connections. Nevertheless x2top ignores this information and 
hanges (at least gives no result in 40 min).</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>So, the question is how to make an itp file with 
predefined protonation (e.g. COOH and NH2 groups).</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Here is a pdb file</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>COMPND&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
?<BR>REMARK&nbsp;&nbsp;&nbsp; File generated by Swiss-PdbViewer&nbsp; 
3.70b15<BR>REMARK&nbsp;&nbsp;&nbsp; <A 
href="http://www.expasy.org/spdbv/">http://www.expasy.org/spdbv/</A><BR>HETATM&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
1&nbsp; C1&nbsp; PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
43.433&nbsp; 46.174&nbsp; 18.374&nbsp; 1.00&nbsp; 
0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp; C2&nbsp; PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 42.232&nbsp; 46.505&nbsp; 18.873&nbsp; 
1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3&nbsp; C3&nbsp; 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 41.148&nbsp; 
45.500&nbsp; 19.008&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4&nbsp; 
C4&nbsp; PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
41.322&nbsp; 44.220&nbsp; 18.637&nbsp; 1.00&nbsp; 
0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp; C5&nbsp; PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 43.713&nbsp; 44.783&nbsp; 17.941&nbsp; 
1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6&nbsp; C6&nbsp; 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 42.617&nbsp; 
43.776&nbsp; 18.072&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7&nbsp; 
C7&nbsp; PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
42.814&nbsp; 42.509&nbsp; 17.658&nbsp; 1.00&nbsp; 
0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8&nbsp; C8&nbsp; PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 44.112&nbsp; 42.120&nbsp; 17.056&nbsp; 
1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9&nbsp; C9&nbsp; 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 45.096&nbsp; 
43.026&nbsp; 16.934&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 10&nbsp; C10 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 44.906&nbsp; 
44.416&nbsp; 17.421&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 11&nbsp; O11 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 45.923&nbsp; 
45.378&nbsp; 17.183&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 12&nbsp; C12 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 46.990&nbsp; 
45.244&nbsp; 18.162&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 13&nbsp; C13 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 48.059&nbsp; 
46.309&nbsp; 17.874&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 14&nbsp; O14 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 47.658&nbsp; 
47.553&nbsp; 18.487&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 15&nbsp; C15 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 49.462&nbsp; 
45.937&nbsp; 18.365&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 16&nbsp; N16 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 50.433&nbsp; 
46.887&nbsp; 17.760&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 17&nbsp; C17 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 51.853&nbsp; 
46.544&nbsp; 17.977&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 18&nbsp; C18 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 52.609&nbsp; 
47.864&nbsp; 18.047&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 19&nbsp; C19 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 52.323&nbsp; 
45.695&nbsp; 16.799&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 20&nbsp; H20 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 44.210&nbsp; 
46.934&nbsp; 18.283&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 21&nbsp; H21 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 42.045&nbsp; 
47.532&nbsp; 19.182&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 22&nbsp; H22 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 40.189&nbsp; 
45.815&nbsp; 19.415&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 23&nbsp; H23 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 40.502&nbsp; 
43.512&nbsp; 18.747&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 24&nbsp; H24 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 42.022&nbsp; 
41.768&nbsp; 17.745&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 25&nbsp; H25 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 44.262&nbsp; 
41.102&nbsp; 16.703&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 26&nbsp; H26 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 46.043&nbsp; 
42.752&nbsp; 16.477&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 27&nbsp; H27 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 46.604&nbsp; 
45.386&nbsp; 19.200&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 28&nbsp; H28 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 47.445&nbsp; 
44.230&nbsp; 18.086&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 29&nbsp; H29 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 48.112&nbsp; 
46.449&nbsp; 16.767&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 30&nbsp; H30 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 46.667&nbsp; 
47.789&nbsp; 18.307&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 31&nbsp; H31 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 49.482&nbsp; 
46.012&nbsp; 19.479&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 32&nbsp; H32 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 49.703&nbsp; 
44.893&nbsp; 18.063&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 33&nbsp; H33 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 50.059&nbsp; 
47.894&nbsp; 17.760&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 34&nbsp; H34 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 52.006&nbsp; 
45.989&nbsp; 18.938&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 35&nbsp; H35 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 52.229&nbsp; 
48.461&nbsp; 18.906&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 36&nbsp; H36 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 53.699&nbsp; 
47.688&nbsp; 18.188&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 37&nbsp; H37 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 52.451&nbsp; 
48.451&nbsp; 17.115&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 38&nbsp; H38 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 51.808&nbsp; 
44.708&nbsp; 16.822&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 39&nbsp; H39 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 52.067&nbsp; 
46.197&nbsp; 15.838&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>HETATM&nbsp;&nbsp; 40&nbsp; H40 
PDR&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 53.421&nbsp; 
45.523&nbsp; 16.846&nbsp; 1.00&nbsp; 0.00<BR>CONECT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
1&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp; 
20&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp; 
21&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4&nbsp;&nbsp; 
22&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6&nbsp;&nbsp; 
23&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6&nbsp;&nbsp; 
10&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
7&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8&nbsp;&nbsp; 
24&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9&nbsp;&nbsp; 
25&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9&nbsp;&nbsp; 10&nbsp;&nbsp; 
26&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 10&nbsp;&nbsp; 
11&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 11&nbsp;&nbsp; 
12&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 12&nbsp;&nbsp; 13&nbsp;&nbsp; 27&nbsp;&nbsp; 
28&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 13&nbsp;&nbsp; 14&nbsp;&nbsp; 15&nbsp;&nbsp; 
29&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 14&nbsp;&nbsp; 
30&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 15&nbsp;&nbsp; 16&nbsp;&nbsp; 31&nbsp;&nbsp; 
32&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 16&nbsp;&nbsp; 17&nbsp;&nbsp; 
33&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 17&nbsp;&nbsp; 18&nbsp;&nbsp; 19&nbsp;&nbsp; 
34&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 18&nbsp;&nbsp; 35&nbsp;&nbsp; 36&nbsp;&nbsp; 
37&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>CONECT&nbsp;&nbsp; 19&nbsp;&nbsp; 38&nbsp;&nbsp; 39&nbsp;&nbsp; 
40&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<BR>SPDBVT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
1.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000000 
<BR>SPDBVT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
1.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000000 
<BR>SPDBVT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.0000000000 
<BR>SPDBVT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000000 
<BR>SPDBVT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000000 
<BR>SPDBVV default;<BR>SPDBVV&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
45.752312478050&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
1769.439927720726&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
20.000000000000<BR>SPDBVV&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.8492806468&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0177824961&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.5276420811 
<BR>SPDBVV&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.4171748744&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.5899083148&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; -0.6913561342 
<BR>SPDBVV&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
-0.3235544887&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.8072744038&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.4935793046 
<BR>SPDBVV&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
46.9440002441&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
44.7815017700&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 17.6585006714 
<BR>SPDBVV&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
0.0000000000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000000 
<BR>SPDBVf 23<BR>SPDBVl 1.00 1.00 1.00 <BR>SPDBVb 0.00 0.00 
0.00<BR>END<BR></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>I have also tried the same file without numbers in 
atom names and without connections.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><FONT face="Times New Roman" size=3>Any help will 
be hightly appreciated.</FONT></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><FONT face="Times New Roman" 
size=3></FONT></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><FONT face="Times New Roman" size=3>Sincerely 
yours,</FONT></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><FONT face="Times New Roman" size=3>V. 
Tanchuk</FONT></DIV></FONT></BODY></HTML>