<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Dear GMXers,<BR>
&nbsp;&nbsp; by looking through the manual, I find that the tabluated interaction functions seem very&nbsp;flexible for performing MD simulations. But some questions puzzle me too much:<BR>
&nbsp; for bonded interactions, as for&nbsp;bonds, angles, dihedrals, the f'(x) are the derivations of f(x)&nbsp;respective to x,&nbsp;here x&nbsp;can be considered as&nbsp;values of bonds, angles, and dihedrals?<BR>
&nbsp; for non-bonded interactions, as for coulomb and LJ, the f'(x) are the derivations of f(x)&nbsp;respective to x,&nbsp;here x&nbsp;can be considered as&nbsp;values of distance between non-bonded atoms?<BR>
&nbsp; Thanks a lot for any reply to this post<BR>
&nbsp; Sincerely,<BR>
&nbsp; Chaofu Wu, Dr.<BR><br /><hr />聊天+搜索+邮箱 想要轻松出游,手机MSN帮你搞定! <a href='http://mobile.msn.com.cn/' target='_new'>立刻下载!</a></body>
</html>