<br>Hi <br><br># g_msd_mpi is part of G R O M A C S:<br>#<br># Giant Rising Ordinary Mutants for A Clerical Setup<br>#<br>@    title &quot;Diffusion Coefficients / Molecule&quot;<br>@    xaxis  label &quot;Molecule&quot;<br>
@    yaxis  label &quot;D&quot;<br>@TYPE xy<br>         0    0.907803<br>         1      3.5355<br>         2     4.34231<br>         3     3.83589<br><br><br>xaxis = Molecule # from .top file<br>yaxis = diffusion coefficient<br>
<br>1. what does the first row represent ? ( Molecule # = 0   ??? )<br>2. what is the unit for the diffusion coefficient ??<br>3. why are the diffusion coefficients quite different for the same type of molecules ( water ) ??<br>
<br><br>Thank you<br>Lin<br><br><br><br><br>