Hello, everyone,<br><br>        Do anybody knows how to calculate the scalar correlation matrix across the alpha carbon atoms, where the correlation function is defined as: Cij=&lt;delta_ri*delta_rj&gt;/squart(&lt;delta_ri^2&gt;&lt;delta_rj^2&gt;).<br>
Is there any direct command can do this in gromacs? Thanks.<br><pre><i><i>   <br></i></i></pre>