<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:times new roman,new york,times,serif;font-size:12pt"><div>Hi all,<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I am facing the problem while calculating backbone RMSD over 30 ns. upto ~6-7 ns g_rms gives correct RMSDs and later all RMSD values are unexpectedly and unusually high (within 20 ps RMSD value shoots up by ~8A). But when i calculate RMSD using g_confrms programme, it gives me expected and usual RMSD. I tried running g_rms separately for that particular time range which was giving me high values only to get same result once again. Is there problem with g_rms or i am calculating wrongly ?<br><br>Regards,<br>Nikhil<br></div></div><br>
      <!--3--><hr size=1></hr> Connect more, do more and share more with Yahoo! India Mail. <a 
href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_galaxy_3/*http://in.overview.mail.yahoo.com/" target="_blank"> Learn more</a>.</body></html>