<div>hi <br></div><div><br></div><div>I have simulated a molecule (not a standard protein) with gmx and now need to compute dihedral angles between specified atoms for all frames of in the .xtc file. </div><div><br></div><div>
Is there any utility along the lines of g_bond whcih computes the dihedral/torsion angle given 4 atom numbers in a index file group ? </div><div><br></div><div>Based on the manual, g_chi and g_dih come close but do not exactly fit the bill. Any work around ? </div>
<div><br></div><div>Thanks </div><div>Sandeep </div><div><br></div><div>--</div><div>Graduate Student </div><div>Chemical Physics</div><div>Univ of Maryland College Park</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div>